Laboratory reports of respiratory infections made to PHE from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 1 to 4, 2016
Updated 6 January 2017
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Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last eight weeks (ie recent specimens).
1. Table 1. Reports of influenza infection made to CIDSC, by week of report
| Week | Week 1 | Week 2 | Week 3 | Week 4 | Total | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Week ending | 10/1/2016 | 17/1/2016 | 24/1/2016 | 31/1/2016 | 听 | 听 |
| Influenza A | 228 | 180 | 325 | 465 | 1197 | 听 |
| Isolation | 27 | 21 | 18 | 58 | 124 | 听 |
| DIF * | 38 | 12 | 18 | 54 | 122 | 听 |
| PCR | 132 | 128 | 267 | 318 | 845 | 听 |
| Other 바카라 사이트� | 31 | 19 | 22 | 34 | 106 | 听 |
| Influenza B | 18 | 23 | 31 | 26 | 98 | 听 |
| Isolation | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 2 | 2 | 4 | 听 |
| DIF * | 1 | 3 | 5 | 5 | 14 | 听 |
| PCR | 8 | 16 | 19 | 19 | 62 | 听 |
| Other 바카라 사이트� | 9 | 4 | 5 | 0 | 18 | 听 |
* DIF = Direct Immunofluorescence.
바카라 사이트� Other = 바카라 사이트淎ntibody detection - single high titre바카라 사이트� or 바카라 사이트淢ethod not specified바카라 사이트�.
2. Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report
| Week | Week 1 | Week 2 | Week 3 | Week 4 | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| Week ending | 10/1/2016 | 17/1/2016 | 24/1/2016 | 31/1/2016 | 听 |
| Adenovirus* | 83 | 83 | 80 | 82 | 328 |
| Coronavirus | 35 | 53 | 40 | 83 | 211 |
| 笔补谤补颈苍蹿濒耻别苍锄补바카라 사이트� | 98 | 95 | 59 | 61 | 313 |
| Rhinovirus | 269 | 197 | 232 | 295 | 993 |
| RSV | 640 | 390 | 345 | 251 | 1626 |
* Respiratory samples only.
바카라 사이트� Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.
3. Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 1 to 4, 2016
| Age group (years) | <1 year | 1-4 years | 5-14 years | 15-44 years | 45-64 years | 鈮�65 years | Unknown | Total |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Adenovirus * | 58 | 82 | 31 | 85 | 51 | 20 | 1 | 328 |
| Coronavirus | 36 | 30 | 16 | 36 | 38 | 55 | 바카라 사이트� | 211 |
| Influenza A | 86 | 176 | 75 | 421 | 419 | 232 | 3 | 1412 |
| Influenza B | 3 | 5 | 9 | 45 | 22 | 18 | 바카라 사이트� | 102 |
| Parainfluenza 바카라 사이트� | 70 | 47 | 20 | 35 | 54 | 87 | 바카라 사이트� | 313 |
| Respiratory syncytial virus | 816 | 173 | 55 | 148 | 188 | 244 | 2 | 1626 |
| Rhinovirus | 333 | 187 | 74 | 118 | 122 | 158 | 1 | 993 |
* Respiratory samples only.
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4. Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report
| Week | Week 1 | Week 2 | Week 3 | Week 4 | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| Week ending | 10/1/2016 | 17/1/2016 | 24/1/2016 | 31/1/2016 | 听 |
| Coxiella burnettii | 1 | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 1 |
| Respiratory Chlamydia sp.* | 1 | 1 | 1 | 바카라 사이트� | 3 |
| Mycoplasma pneumoniae | 25 | 30 | 30 | 22 | 107 |
| Legionella sp. | 14 | 2 | 10 | 6 | 32 |
* Includes Chlamydia psittaci, Chlamydia pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.
5. Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report
| Week | Week 1 | Week 2 | Week 3 | Week 4 | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| Week ending | 10/1/2016 | 17/1/2016 | 24/1/2016 | 31/1/2016 | 听 |
| Nosocomial | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 0 |
| Community | 7 | 바카라 사이트� | 8 | 3 | 18 |
| Travel abroad | 4 | 2 | 1 | 3 | 10 |
| Travel UK | 3 | 바카라 사이트� | 1 | 바카라 사이트� | 4 |
| Total | 14 | 2 | 10 | 6 | 32 |
| Male | 10 | 1 | 8 | 4 | 23 |
| Female | 4 | 1 | 2 | 2 | 9 |
Thirty-two cases were reported with pneumonia. Twenty-three males aged 35-95 years and nine females aged 35-78 years. Eighteen cases had community-acquired infection. Four deaths were reported in three males aged 45-87 years and a female aged 62 years.
Fourteen cases were reported with travel association: Belgium (1), Indonesia/Singapore (1), Malta/United Kingdom (1), Malaysia/Singapore/Thailand (1), Spain (1), United Arab Emirates (5) and United Kingdom (4).
6. Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 1 to 4, 2016
| Region/Country | Nosocomial | Community | Travel Abroad | Travel UK | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| North of England | 听 | 听 | 听 | 听 | 听 |
| North East | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 2 | 바카라 사이트� | 2 |
| Cheshire & Merseyside | 바카라 사이트� | 1 | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 1 |
| Greater Manchester | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 0 |
| Cumbria & Lancashire | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 0 |
| Yorkshire & the Humber | 바카라 사이트� | 2 | 1 | 1 | 4 |
| South of England | 听 | 听 | 听 | 听 | 听 |
| Devon, Cornwall & Somerset | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 0 |
| Avon, Gloucestershire & Wiltshire | 바카라 사이트� | 2 | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 2 |
| Wessex | 바카라 사이트� | 1 | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 1 |
| Thames Valley | 바카라 사이트� | 1 | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 1 |
| Sussex, Surrey & Kent | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 2 | 바카라 사이트� | 2 |
| Midlands & East of England | 听 | 听 | 听 | 听 | 听 |
| East Midlands | 바카라 사이트� | 1 | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 1 |
| South Midlands & Hertfordshire | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 0 |
| Anglia & Essex | 바카라 사이트� | 1 | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 1 |
| West Midlands | 바카라 사이트� | 7 | 2 | 바카라 사이트� | 9 |
| London Integrated Region | 听 | 听 | 听 | 听 | 听 |
| London | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 3 | 1 | 4 |
| Public Health Wales | 听 | 听 | 听 | 听 | 听 |
| Mid & West Wales | 바카라 사이트� | 1 | 바카라 사이트� | 1 | 2 |
| North Wales | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 0 |
| South East Wales | 바카라 사이트� | 1 | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 1 |
| Miscellaneous | 听 | 听 | 听 | 听 | 听 |
| Other | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 1 | 1 |
| Not known | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 바카라 사이트� | 0 |
| Total | 0 | 18 | 10 | 4 | 32 |
This report was published in Health Protection Report volume 10 issue 5.