Research and analysis

Laboratory reports of respiratory infections made to PHE from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 26 to 30, 2016

Updated 6 January 2017

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Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last 8 weeks (ie recent specimens).

1. Table 1. Reports of influenza infection made to PHE, by week of report

Week Week 26 Week 27 Week 28 Week 29 Week 30 Total
Week ending 3/7/2016 10/7/20165 17/7/2016 24/7/2016 31/7/2016 Β 
Influenza A 7 13 9 19 7 55
Isolation 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
DIF * 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
PCR 6 5 8 11 4 34
Other 바카라 사이트  1 8 1 6 3 19
Influenza B 6 3 5 7 1 22
Isolation 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
DIF * 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
PCR 6 2 5 5 0 18
Other 바카라 사이트  바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 2 1 4

* DIF = Direct Immunofluorescence.

바카라 사이트  Other = 바카라 사이트œAntibody detection - single high titre바카라 사이트 or 바카라 사이트œMethod not specified바카라 사이트.

2. Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report

Week Week 26 Week 27 Week 28 Week 29 Week 30 Total
Week ending 3/7/2016 10/7/20165 17/7/2016 24/7/2016 31/7/2016 Β 
Adenovirus* 99 96 90 95 80 460
Coronavirus 11 4 6 5 7 33
Parainfluenza바카라 사이트  113 79 94 82 78 446
Rhinovirus 266 235 287 256 242 1286
RSV 49 54 60 68 61 292

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

3. Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 9 to 13, 2016

Age group (years) <1 year 1-4 years 5-14 years 15-44 years 45-64 years β‰₯65 years Unknown Total
Adenovirus * 61 118 36 138 77 29 1 460
Coronavirus 5 5 1 7 11 4 바카라 사이트“ 33
Influenza A 1 2 바카라 사이트“ 22 15 19 바카라 사이트“ 59
Influenza B 1 3 1 9 2 4 바카라 사이트“ 20
Parainfluenza 바카라 사이트  99 80 40 60 81 86 바카라 사이트“ 446
Respiratory syncytial virus 111 52 19 51 33 26 바카라 사이트“ 292
Rhinovirus 337 251 128 220 167 179 4 1286

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

4. Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report

Week Week 26 Week 27 Week 28 Week 29 Week 30 Total
Week ending 3/7/2016 10/7/20165 17/7/2016 24/7/2016 31/7/2016 Β 
Coxiella burnettii 1 2 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3
Respiratory Chlamydia sp.* 바카라 사이트“ 3 1 1 바카라 사이트“ 5
Mycoplasma pneumoniae 12 14 17 13 3 59
Legionella sp. 6 6 9 8 6 35

* Includes Chlamydia Psittaci, Chlamydia Pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.

5. Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report

Week Week 26 Week 27 Week 28 Week 29 Week 30 Total
Week ending 3/7/2016 10/7/20165 17/7/2016 24/7/2016 31/7/2016 Β 
Nosocomial 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 1
Community 2 2 6 4 3 17
Travel abroad 3(1*) 4 3 3 바카라 사이트“ 13
Travel UK 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 2 4
Total 6 6 9 8 6 35
Male 5 2 7 5 5 24
Female 1 4 2 3 1 11

Thirty-four cases were reported with pneumonia and one case had non-pneumonic infection: 24males aged 41 - 86 years and 11 females aged 51 - 81 years. Seventeen cases had community-acquired infection. Two deaths were reported: in a female aged 62 and a male aged 72.

Seventeen cases were reported with travel association: Bulgaria (1), China (1), Greece/Italy (1), Indonesia (1), India (1), Italy (1), Malta (1), Spain (3), Turkey (2), Ukraine (1) and United Kingdom (4).

6. Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 26 to 30, 2016

Region/Country Nosocomial Community Travel Abroad Travel UK Total
North of England Β  Β  Β  Β  Β 
North East 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Cheshire & Merseyside 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Greater Manchester 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Cumbria & Lancashire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Yorkshire & the Humber 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 4(1*) 1 5
South of England Β  Β  Β  Β  Β 
Devon, Cornwall & Somerset 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Avon, Gloucestershire & Wiltshire 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Wessex 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1 2
Thames Valley 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Sussex, Surrey & Kent 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Midlands & East of England Β  Β  Β  Β  Β 
East Midlands 바카라 사이트“ 3 바카라 사이트“ 1 4
South Midlands & Hertfordshire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Anglia & Essex 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
West Midlands 바카라 사이트“ 2 1 바카라 사이트“ 3
London Integrated Region Β  Β  Β  Β  Β 
London 1 2 3 1 7
Public Health Wales Β  Β  Β  Β  Β 
Mid & West Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
North Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
South East Wales 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2
Miscellaneous Β  Β  Β  Β  Β 
Other 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Not known 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Total 1 17 13 4 35

* Non-pneumonic case

This report was published in Health Protection Report volume 10 issue 25.

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