Research and analysis

Laboratory reports of respiratory infections made to PHE from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 9 to 13, 2016

Updated 6 January 2017

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Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last 8 weeks (ie recent specimens).

1. Table 1. Reports of influenza infection made to PHE, by week of report

Week Week 9 Week 10 Week 11 Week 12 Week 13 Total
Week ending 6/3/2016 13/3/20165 20/3/2016 27/3/2016 3/4/2016 Β 
Influenza A 722 809 782 529 503 3345
Isolation 60 31 37 72 28 228
DIF * 27 21 84 64 45 241
PCR 575 706 605 357 393 2636
Other 바카라 사이트  60 51 56 36 37 240
Influenza B 147 225 324 370 427 1493
Isolation 11 15 31 49 44 150
DIF * 8 11 47 45 33 144
PCR 121 187 229 262 319 1118
Other 바카라 사이트  7 12 17 14 31 81

* DIF = Direct Immunofluorescence.

바카라 사이트  Other = 바카라 사이트œAntibody detection - single high titre바카라 사이트 or 바카라 사이트œMethod not specified바카라 사이트.

2. Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report

Week Week 9 Week 10 Week 11 Week 12 Week 13 Total
Week ending 6/3/2016 13/3/20165 20/3/2016 27/3/2016 3/4/2016 Β 
Adenovirus* 106 95 113 100 122 536
Coronavirus 138 125 142 119 75 599
Parainfluenza바카라 사이트  72 77 54 83 84 370
Rhinovirus 253 206 257 225 223 1164
RSV 164 132 158 125 130 709

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

3. Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 9 to 13, 2016

Age group (years) <1 year 1-4 years 5-14 years 15-44 years 45-64 years β‰₯65 years Unknown Total
Adenovirus * 101 166 46 135 57 31 바카라 사이트“ 536
Coronavirus 89 84 35 95 104 192 바카라 사이트“ 599
Influenza A 210 457 186 1077 1213 1047 1 4191
Influenza B 92 199 318 843 250 359 1 2062
Parainfluenza 바카라 사이트  86 87 16 40 63 78 바카라 사이트“ 370
Respiratory syncytial virus 162 102 54 144 126 120 1 709
Rhinovirus 321 232 109 178 152 171 1 1164

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

4. Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report

Week Week 9 Week 10 Week 11 Week 12 Week 13 Total
Week ending 6/3/2016 13/3/20165 20/3/2016 27/3/2016 3/4/2016 Β 
Coxiella burnettii 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Respiratory Chlamydia sp.* 2 2 2 1 바카라 사이트“ 7
Mycoplasma pneumoniae 16 23 21 9 8 77
Legionella sp. 5 4 1 바카라 사이트“ 5 15

* Includes Chlamydia Psittaci, Chlamydia Pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.

5. Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report

Week Week 9 Week 10 Week 11 Week 12 Week 13 Total
Week ending 6/3/2016 13/3/20165 20/3/2016 27/3/2016 3/4/2016 Β 
Nosocomial 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Community 5 3 1 바카라 사이트“ 3 12
Travel abroad 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2 2
Travel UK 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Total 5 4 1 0 5 15
Male 4 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 4 9
Female 1 4 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 6

Fifteen cases were reported with pneumonia: one male aged 43 바카라 사이트“ 78 years and six females aged 34 바카라 사이트“ 81 years. Twelve cases had community-acquired infection. One death was reported in 74 year-old female.

Three cases were reported with travel association: Cambodia/Thailand (1), United Kingdom (1) and the United States of America (1).

6. Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 9 to 13, 2016

Region/Country Nosocomial Community Travel Abroad Travel UK Total
North of England Β  Β  Β  Β  Β 
North East 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Cheshire & Merseyside 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Greater Manchester 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Cumbria & Lancashire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Yorkshire & the Humber 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
South of England Β  Β  Β  Β  Β 
Devon, Cornwall & Somerset 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Avon, Gloucestershire & Wiltshire 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Wessex 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Thames Valley 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Sussex, Surrey & Kent 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Midlands & East of England Β  Β  Β  Β  Β 
East Midlands 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
South Midlands & Hertfordshire 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1 2
Anglia & Essex 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
West Midlands 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2
London Integrated Region Β  Β  Β  Β  Β 
London 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2
Public Health Wales Β  Β  Β  Β  Β 
Mid & West Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
North Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
South East Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Miscellaneous Β  Β  Β  Β  Β 
Other 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Not known 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Total 0 12 2 1 15

* Non-pneumonic case

This report was published in Health Protection Report volume 10 issue 14.

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