Research and analysis

Laboratory reports of respiratory infections made to PHE from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 48 to 52, 2016

Updated 6 January 2017

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Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last 8 weeks (ie recent specimens).

1. Table 1. Reports of influenza infection made to PHE, by week of report

Week Week 48 Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Total
Week ending 4/12/2016 11/12/2016 18/12/2016 25/12/2016 1/1/2017 Β 
Influenza A 74 145 260 475 530 1484
Isolation 13 17 22 42 55 149
DIF * 4 7 15 39 60 125
PCR 55 118 201 369 388 1131
Other 바카라 사이트  2 3 22 25 27 79
Influenza B 4 7 7 8 9 35
Isolation 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
DIF * 1 1 2 2 3 9
PCR 2 6 4 6 6 24
Other 바카라 사이트  1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1

* DIF = Direct Immunofluorescence.

바카라 사이트  Other = 바카라 사이트œAntibody detection - single high titre바카라 사이트 or 바카라 사이트œMethod not specified바카라 사이트.

2. Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report

Week Week 48 Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Total
Week ending 4/12/2016 11/12/2016 18/12/2016 25/12/2016 1/1/2017 Β 
Adenovirus* 87 76 69 65 67 364
Coronavirus 26 27 39 32 42 166
Parainfluenza바카라 사이트  77 96 67 80 88 408
Rhinovirus 360 369 317 378 248 1672
RSV 869 1036 898 818 650 4271

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

3. Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 48 to 52, 2016

Age group (years) <1 year 1-4 years 5-14 years 15-44 years 45-64 years β‰₯65 years Unknown Total
Adenovirus * 91 89 29 72 50 33 바카라 사이트“ 364
Coronavirus 34 19 4 27 35 47 바카라 사이트“ 166
Influenza A 51 59 83 402 381 860 2 1838
Influenza B 1 8 7 10 8 9 1 44
Parainfluenza 바카라 사이트  108 71 19 56 69 85 바카라 사이트“ 408
Respiratory syncytial virus 2490 533 93 204 351 599 1 4271
Rhinovirus 590 261 106 225 217 273 바카라 사이트“ 1672

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

4. Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report

Week Week 48 Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Total
Week ending 4/12/2016 11/12/2016 18/12/2016 25/12/2016 1/1/2017 Β 
Coxiella burnettii 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Respiratory Chlamydia sp.* 2 3 3 1 바카라 사이트“ 9
Mycoplasma pneumoniae 13 19 16 14 4 66
Legionella sp. 7 4 7 9 4 31

* Includes Chlamydia Psittaci, Chlamydia Pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.

5. Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report

Week Week 48 Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Total
Week ending 4/12/2016 11/12/2016 18/12/2016 25/12/2016 1/1/2017 Β 
Nosocomial 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Community 3 2 3 6 3 17
Travel abroad 3 2 4 2 바카라 사이트“ 11
Travel UK 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 1 3
Total 7 4 7 9 4 31
Male 5 2 5 4 3 19
Female 2 2 2 5 1 12

Thirty-one cases were reported with pneumonia. Nineteen males aged 21 - 70 years and 12 females aged 28 - 90 years. Seventeen cases had community-acquired infection.

Fourteen cases were reported with travel association: Cape Verde (1), Cruise/ United Arab Emirates (1), France (1), Italy (1), Jordon (1), Thailand (1), United Arab Emirates (5) and United Kingdom (3).

6. Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 48 to 52, 2016

Region/Country Nosocomial Community Travel Abroad Travel UK Total
North of England Β  Β  Β  Β  Β 
North East 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Cheshire & Merseyside 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Greater Manchester 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3 바카라 사이트“ 3
Cumbria & Lancashire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Yorkshire & the Humber 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
South of England Β  Β  Β  Β  Β 
Devon, Cornwall & Somerset 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Avon, Gloucestershire & Wiltshire 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Wessex 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Thames Valley 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Sussex, Surrey & Kent 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3 1 4
Midlands & East of England Β  Β  Β  Β  Β 
East Midlands 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
South Midlands & Hertfordshire 바카라 사이트“ 3 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3
Anglia & Essex 바카라 사이트“ 2 1 바카라 사이트“ 3
West Midlands 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 2
London Integrated Region Β  Β  Β  Β  Β 
London 바카라 사이트“ 1 2 1 4
Public Health Wales Β  Β  Β  Β  Β 
Mid & West Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
North Wales 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2
South East Wales 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Miscellaneous Β  Β  Β  Β  Β 
Other 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Not known 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 2
Total 0 10 21 2 33

This report was published in Health Protection Report volume 11 issue 1.

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