Laboratory reports of respiratory infections made to PHE from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 44 to 47, 2016
Updated 6 January 2017
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Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last eight weeks (ie recent specimens).
1. Table 1. Reports of influenza infection made to PHE Colindale, by week of report
| Week | Week 44 | Week 45 | Week 46 | Week 47 | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| Week ending | 6/11/2016 | 13/11/2016 | 20/11/2016 | 27/11/2016 | Β |
| Influenza A | 33 | 31 | 51 | 37 | 152 |
| Isolation | 1 | 4 | 8 | 11 | 24 |
| DIF * | 2 | 2 | 바카라 사이트 | 2 | 6 |
| PCR | 22 | 25 | 43 | 24 | 114 |
| Other 바카라 사이트 | 7 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 7 |
| Influenza B | 8 | 3 | 6 | 7 | 24 |
| Isolation | 1 | 바카라 사이트 | 1 | 바카라 사이트 | 2 |
| DIF * | 1 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 1 |
| PCR | 5 | 3 | 5 | 4 | 17 |
| Other 바카라 사이트 | 1 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 3 | 4 |
* DIF = Direct Immunofluorescence.
바카라 사이트 Other = 바카라 사이트Antibody detection - single high titre바카라 사이트 or 바카라 사이트Method not specified바카라 사이트.
2. Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report
| Week | Week 44 | Week 45 | Week 46 | Week 47 | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| Week ending | 6/11/2016 | 13/11/2016 | 20/11/2016 | 27/11/2016 | Β |
| Adenovirus* | 81 | 45 | 66 | 79 | 271 |
| Coronavirus | 17 | 13 | 14 | 46 | 90 |
| Parainfluenza바카라 사이트 | 85 | 51 | 71 | 100 | 307 |
| Rhinovirus | 415 | 243 | 322 | 352 | 1332 |
| RSV | 439 | 386 | 654 | 878 | 2357 |
* Respiratory samples only.
바카라 사이트 Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.
3. Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 44 to 47, 2016
| Age group (years) | <1 year | 1-4 years | 5-14 years | 15-44 years | 45-64 years | β₯65 years | Unknown | Total |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Adenovirus * | 56 | 93 | 17 | 60 | 31 | 14 | 바카라 사이트 | 271 |
| Coronavirus | 15 | 9 | 12 | 12 | 16 | 26 | 바카라 사이트 | 90 |
| Influenza A | 5 | 3 | 15 | 46 | 26 | 64 | 1 | 160 |
| Influenza B | 3 | 6 | 1 | 9 | 바카라 사이트 | 2 | 바카라 사이트 | 21 |
| Parainfluenza 바카라 사이트 | 70 | 55 | 29 | 28 | 59 | 66 | 바카라 사이트 | 307 |
| Respiratory syncytial virus | 1541 | 445 | 36 | 85 | 114 | 136 | 바카라 사이트 | 2357 |
| Rhinovirus | 414 | 217 | 73 | 200 | 188 | 240 | 바카라 사이트 | 1332 |
* Respiratory samples only.
바카라 사이트 Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.
4. Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report
| Week | Week 44 | Week 45 | Week 46 | Week 47 | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| Week ending | 6/11/2016 | 13/11/2016 | 20/11/2016 | 27/11/2016 | Β |
| Coxiella burnettii | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 0 |
| Respiratory Chlamydia sp.* | 1 | 1 | 1 | 36 | 39 |
| Mycoplasma pneumoniae | 11 | 11 | 11 | 13 | 46 |
| Legionella sp. | 7 | 10 | 10 | 6 | 33 |
* Includes Chlamydia psittaci, Chlamydia pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.
5. Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report
| Week | Week 44 | Week 45 | Week 46 | Week 47 | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| Week ending | 6/11/2016 | 13/11/2016 | 20/11/2016 | 27/11/2016 | Β |
| Nosocomial | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 0 |
| Community | 3 | 2 | 3 | 2 | 10 |
| Travel abroad | 2 | 8 | 7 | 4 | 21 |
| Travel UK | 2 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 2 |
| Total | 7 | 10 | 10 | 6 | 33 |
| Male | 6 | 8 | 7 | 3 | 24 |
| Female | 1 | 2 | 3 | 3 | 9 |
Thirty-three cases were reported with pneumonia: 24 males aged 41-78 years and nine females aged 55-78 years. Ten cases had community-acquired infection.
Twenty-three cases were reported with travel association: Belgium/Italy (1), India (1), Indonesia (2), Italy (1), Italy/United Kingdom (1), Jamaica (1), Malaysia (1), Portugal (1), Saudi Arabia (1), Spain (3), Thailand (1), United Arab Emirates (6), United Arab Emirates /United Kingdom (1) and United Kingdom (2).
6. Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 44 to 47, 2016
| Region/Country | Nosocomial | Community | Travel Abroad | Travel UK | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| North of England | Β | Β | Β | Β | Β |
| North East | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 1 | 바카라 사이트 | 1 |
| Cheshire & Merseyside | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 1 | 바카라 사이트 | 1 |
| Greater Manchester | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 3 | 바카라 사이트 | 3 |
| Cumbria & Lancashire | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 0 |
| Yorkshire & the Humber | 바카라 사이트 | 1 | 1 | 바카라 사이트 | 2 |
| South of England | Β | Β | Β | Β | Β |
| Devon, Cornwall & Somerset | 바카라 사이트 | 1 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 1 |
| Avon, Gloucestershire & Wiltshire | 바카라 사이트 | 1 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 1 |
| Wessex | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 0 |
| Thames Valley | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 0 |
| Sussex, Surrey & Kent | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 3 | 1 | 4 |
| Midlands & East of England | Β | Β | Β | Β | Β |
| East Midlands | 바카라 사이트 | 1 | 4 | 바카라 사이트 | 5 |
| South Midlands & Hertfordshire | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 0 |
| Anglia & Essex | 바카라 사이트 | 2 | 1 | 바카라 사이트 | 3 |
| West Midlands | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 2 | 바카라 사이트 | 2 |
| London Integrated Region | Β | Β | Β | Β | Β |
| London | 바카라 사이트 | 1 | 2 | 1 | 4 |
| Public Health Wales | Β | Β | Β | Β | Β |
| Mid & West Wales | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 1 | 바카라 사이트 | 1 |
| North Wales | 바카라 사이트 | 2 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 2 |
| South East Wales | 바카라 사이트 | 1 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 1 |
| Miscellaneous | Β | Β | Β | Β | Β |
| Other | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 0 |
| Not known | 바카라 사이트 | 바카라 사이트 | 2 | 바카라 사이트 | 2 |
| Total | 0 | 10 | 21 | 2 | 33 |
This HPR report was published on 2 December 2016.