Research and analysis

Laboratory reports of respiratory infections made to PHE from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 49 to 53, 2015

Updated 12 January 2016

Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last 8 weeks (ie recent specimens).

1. Table 1. Reports of influenza infection made to PHE, by week of report

Week Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Week 53 Total
Week ending 6/12/2015 13/12/2015 20/12/2015 27/12/2015 3/1/2016 Β 
Influenza A 37 25 75 94 119 350
Isolation 1 4 6 6 17 34
DIF * 6 바카라 사이트“ 8 12 19 45
PCR 27 19 56 59 79 240
Other 바카라 사이트  3 2 5 17 4 31
Influenza B 15 9 10 10 14 58
Isolation 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2
DIF * 3 바카라 사이트“ 3 2 바카라 사이트“ 8
PCR 12 8 6 6 14 46
Other 바카라 사이트  바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 2

* DIF = Direct Immunofluorescence.

바카라 사이트  Other = 바카라 사이트œAntibody detection - single high titre바카라 사이트 or 바카라 사이트œMethod not specified바카라 사이트.

2. Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report

Week Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Week 53 Total
Week ending 6/12/2015 13/12/2015 20/12/2015 27/12/2015 3/1/2016 Β 
Adenovirus* 93 78 87 81 79 418
Coronavirus 6 20 21 20 30 97
Parainfluenza바카라 사이트  130 89 124 70 86 499
Rhinovirus 310 289 330 214 293 1436
RSV 1046 961 972 656 633 4268

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

3. Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 49 to 53, 2015

Age group (years) <1 year 1-4 years 5-14 years 15-44 years 45-64 years β‰₯65 years Unknown Total
Adenovirus * 109 118 38 84 52 17 바카라 사이트“ 418
Coronavirus 21 13 11 15 18 19 바카라 사이트“ 97
Influenza A 49 86 34 191 140 65 바카라 사이트“ 565
Influenza B 2 9 11 23 6 9 바카라 사이트“ 60
Parainfluenza 바카라 사이트  117 100 57 67 73 85 바카라 사이트“ 499
Respiratory syncytial virus 2865 603 122 188 236 250 4 4268
Rhinovirus 610 257 89 166 156 158 바카라 사이트“ 1436

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

4. Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report

Week Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Week 53 Total
Week ending 6/12/2015 13/12/2015 20/12/2015 27/12/2015 3/1/2016 Β 
Coxiella burnettii 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Respiratory Chlamydia sp.* 3 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 5
Mycoplasma pneumoniae 26 25 15 14 12 92
Legionella sp. 7 8 10 10 1 36

* Includes Chlamydia Psittaci, Chlamydia Pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.

5. Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report

Week Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Week 53 Total
Week ending 6/12/2015 13/12/2015 20/12/2015 27/12/2015 3/1/2016 Β 
Nosocomial 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Community 6 3 1 3 바카라 사이트“ 13
Travel abroad 1 2 8 6 1 18
Travel UK 바카라 사이트“ 2 1(1*) 1 바카라 사이트“ 4
Total 7 8 10 10 1 36
Male 6 7 7 5 바카라 사이트“ 25
Female 1 1 3 5 1 11

Thirty-five cases were reported with pneumonia and one case had non-pneumonic infection. Twenty-five males aged 26 바카라 사이트“ 84 years and 11 females aged 48 바카라 사이트“ 82 years. Thirteen cases had community-acquired infection and one case was reported to be associated with a hospital/healthcare facility. One death was reported in a male aged 42 years.

Thirty-five cases were reported with travel association: Belgium (1), Cyprus/Turkey (1), France (1), Italy (1), Jamaica (1), Kosovo/Macedonia (1), Malaysia (1), Mauritius (1), Oman (1), Pakistan (1), Pakistan/United Kingdom (1), Spain (1), Thailand (2), United Arab Emirates (3), United Kingdom (4) and the United States of America (1).

6. Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 49 to 53, 2015

Region/Country Nosocomial Community Travel Abroad Travel UK Total
North of England Β  Β  Β  Β  Β 
North East 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Cheshire & Merseyside 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Greater Manchester 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 1(1*) 3
Cumbria & Lancashire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Yorkshire & the Humber 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
South of England Β  Β  Β  Β  Β 
Devon, Cornwall & Somerset 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Avon, Gloucestershire & Wiltshire 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 1 3
Wessex 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Thames Valley 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Sussex, Surrey & Kent 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3 바카라 사이트“ 3
Midlands & East of England Β  Β  Β  Β  Β 
East Midlands 바카라 사이트“ 5 바카라 사이트“ 1 6
South Midlands & Hertfordshire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3 바카라 사이트“ 3
Anglia & Essex 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
West Midlands 바카라 사이트“ 1 2 바카라 사이트“ 3
London Integrated Region Β  Β  Β  Β  Β 
London 1 바카라 사이트“ 5 1 7
Public Health Wales Β  Β  Β  Β  Β 
Mid & West Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
North Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
South East Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Miscellaneous Β  Β  Β  Β  Β 
Other 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Not known 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Total 1 13 18 4 36

* Non-pneumonic case

This report was published in Health Protection Report volume 10 issue 1.