Research and analysis

Laboratory reports of respiratory infections made to PHE from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 36 to 39, 2015

Updated 12 January 2016

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Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last eight weeks (ie recent specimens).

1. Table 1. Reports of influenza infection made to CIDSC, by week of report

Week Week 36 Week 37 Week 38 Week 39 Total
Week ending 6/9/2015 13/9/2015 20/9/2015 27/9/2015 Β 
INFLUENZA A 3 4 17 8 32
Isolation 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 1
DIF * 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
PCR 2 2 5 7 16
Other 바카라 사이트  1 2 12 바카라 사이트“ 15
INFLUENZA B 3 2 4 3 12
Isolation 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
DIF * 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
PCR 2 2 1 3 8
Other 바카라 사이트  바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3 바카라 사이트“ 3

* DIF = Direct Immunofluorescence.

바카라 사이트  Other = 바카라 사이트œAntibody detection - single high titre바카라 사이트 or 바카라 사이트œMethod not specified바카라 사이트.

2. Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report

Week Week 36 Week 37 Week 38 Week 39 Total
Week ending 6/9/2015 13/9/2015 20/9/2015 27/9/2015 Β 
Adenovirus* 37 42 35 63 177
Coronavirus 2 1 2 1 6
Parainfluenza바카라 사이트  24 37 35 51 147
Rhinovirus 128 133 241 313 815
RSV 25 24 38 67 154

* Respiratory samples only

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

3. Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 36 to 39, 2015

Age group (years) <1 year 1-4 years 5-14 years 15-44 years 45-64 years β‰₯65 years Unknown Total
Adenovirus * 25 42 18 65 16 11 바카라 사이트“ 177
Coronavirus 1 바카라 사이트“ 1 1 1 2 바카라 사이트“ 6
Influenza A 3 1 2 8 15 6 바카라 사이트“ 35
Influenza B 바카라 사이트“ 2 2 3 2 4 바카라 사이트“ 13
Parainfluenza 바카라 사이트  30 36 12 14 31 24 바카라 사이트“ 147
Respiratory syncytial virus 71 28 9 22 15 9 바카라 사이트“ 154
Rhinovirus 238 170 67 143 113 83 1 815

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

4. Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report

Week Week 36 Week 37 Week 38 Week 39 Total
Week ending 6/9/2015 13/9/2015 20/9/2015 27/9/2015 Β 
Coxiella burnettii 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Respiratory Chlamydia sp.* 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Mycoplasma pneumoniae 7 3 3 2 15
Legionella sp. 15 11 18 10 54

* Includes Chlamydia Psittaci, Chlamydia Pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.

5. Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report

Week Week 36 Week 37 Week 38 Week 39 Total
Week ending 6/9/2015 13/9/2015 20/9/2015 27/9/2015 Β 
Nosocomial 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 1
Community 7 6 9 3 25
Travel abroad 7 4 7 (1*) 4 (1*) 22
Travel UK 1 1 2 2 6
Total 15 11 18 10 54
Male 13 8 14 8 43
Female 2 3 4 2 11

Fifty-two cases were reported with pneumonia and two had non-pneumonic infection. Forty-three males aged 33 - 89 years and eleven females aged 44 - 85 years. Twenty-five cases had community-acquired infection and one case was reported to be associated with a hospital/healthcare facility.

Twenty-eight cases were reported with travel association: Bulgaria (3), France (3), France/United Kingdom (1), Greece (2), Italy (4), Spain (3), Spain/United Kingdom (1), Thailand (1), United Arab Emirates (1), United Kingdom (6) and United States of America (3).

6. Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 36 to 39, 2015

Region/Country Nosocomial Community Travel Abroad Travel UK Total
North of England Β  Β  Β  Β  Β 
North East 바카라 사이트“ 1 3 (1*) 바카라 사이트“ 4
Cheshire & Merseyside 바카라 사이트“ 2 1 바카라 사이트“ 3
Greater Manchester 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 1 2
Cumbria & Lancashire 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Yorkshire & the Humber 바카라 사이트“ 1 3 (1*) 바카라 사이트“ 4
South of England Β  Β  Β  Β  Β 
Devon, Cornwall & Somerset 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Avon, Gloucestershire & Wiltshire 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2
Wessex 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Thames Valley 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Sussex, Surrey & Kent 1 1 2 3 7
Midlands & East of England Β  Β  Β  Β  Β 
East Midlands 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 1 2
South Midlands & Hertfordshire 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Anglia & Essex 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
West Midlands 바카라 사이트“ 7 3 바카라 사이트“ 10
London Integrated Region Β  Β  Β  Β  Β 
London 바카라 사이트“ 6 2 바카라 사이트“ 8
Public Health Wales Β  Β  Β  Β  Β 
Mid & West Wales 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
North Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
South East Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Miscellaneous Β  Β  Β  Β  Β 
Other 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
Not known 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2 1 3
Total 1 25 22 6 54

* Non-pneumonic case

This report was published in Health Protection Report volume 9 issue 35.

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