Research and analysis

Laboratory reports of respiratory infections made to CIDSC from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 23 to 26, 2015

Updated 12 January 2016

Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last 8 weeks (ie recent specimens).

1. Table 1. Reports of influenza infection made to CIDSC, by week of report

Week Week 23 Week 24 Week 25 Week 26 Total
Week ending 7/6/2015 14/6/2015 21/6/2015 28/6/2015 Β 
Influenza A 7 8 19 8 42
Isolation 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 1
DIF * 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
PCR 5 5 10 4 24
Other 바카라 사이트  2 3 8 3 16
Influenza B 29 54 18 6 107
Isolation 4 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 6
DIF * 4 8 5 바카라 사이트“ 17
PCR 19 44 5 5 73
Other 바카라 사이트  2 2 6 1 11

* DIF = Direct Immunofluorescence.

바카라 사이트  Other = 바카라 사이트œAntibody detection - single high titre바카라 사이트 or 바카라 사이트œMethod not specified바카라 사이트.

2. Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report

Week Week 23 Week 24 Week 25 Week 26 Total
Week ending 7/6/2015 14/6/2015 21/6/2015 28/6/2015 Β 
Adenovirus* 106 84 90 90 370
Coronavirus 7 6 3 4 20
Parainfluenza바카라 사이트  90 80 85 84 339
Rhinovirus 233 202 196 184 815
RSV 59 46 43 30 178

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

3. Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 23 to 26, 2015

Age group (years) <1 year 1-4 years 5-14 years 15-44 years 45-64 years β‰₯65 years Unknown Total
Adenovirus * 71 79 29 112 54 25 바카라 사이트“ 370
Coronavirus 바카라 사이트“ 3 1 5 6 5 바카라 사이트“ 20
Influenza A 2 1 3 8 15 19 바카라 사이트“ 48
Influenza B 5 10 7 24 28 32 바카라 사이트“ 106
Parainfluenza 바카라 사이트  61 56 16 49 85 71 1 339
Respiratory syncytial virus 61 27 16 16 21 36 1 178
Rhinovirus 250 154 91 139 103 75 3 815

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

4. Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report

Week Week 23 Week 24 Week 25 Week 26 Total
Week ending 7/6/2015 14/6/2015 21/6/2015 28/6/2015 Β 
Coxiella burnettii 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Respiratory Chlamydia sp.* 2 3 2 바카라 사이트“ 7
Mycoplasma pneumoniae 13 5 7 바카라 사이트“ 25
Legionella sp. 3 8 12 12 35

* Includes Chlamydia Psittaci, Chlamydia Pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.

5. Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report

Week Week 23 Week 24 Week 25 Week 26 Total
Week ending 7/6/2015 14/6/2015 21/6/2015 28/6/2015 Β 
Nosocomial 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 2
Community 1 3 3 2 9
Travel abroad 2 5 6 10 23
Travel UK 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Total 3 8 12 12 35
Male 1 5 9 9 24
Female 2 3 3 3 11

Thirty-five cases were reported with pneumonia. Twenty-four males aged 36 to 89 years and 11 females aged 33 to 86 years. Nine cases had community-acquired infection and two cases were reported to be associated with hospital/healthcare facilities. Two deaths were reported in males aged 79 and 86 years.

Twenty-four cases were reported with travel association: China (1), Croatia (1), Cruise (1), Cruise/France/Italy/Spain (1), Greece (2), Greece/Turkey (1), Greece/United Kingdom (1), India (1), Italy (2), Pakistan (1), Portugal (2), Spain (4), Turkey/United Kingdom(1), United Arab Emirates (2), United Kingdom (1) and United States of America (2).

6. Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 23 to 26, 2015

Region/Country Nosocomial Community Travel Abroad Travel UK Total
North of England Β  Β  Β  Β  Β 
North East 바카라 사이트“ 1 4 - 5
Cheshire & Merseyside 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Greater Manchester 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 2
Cumbria & Lancashire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Yorkshire & the Humber 1 바카라 사이트“ 3 바카라 사이트“ 4
South of England Β  Β  Β  Β  Β 
Devon, Cornwall & Somerset 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Avon, Gloucestershire & Wiltshire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2 바카라 사이트“ 2
Wessex 바카라 사이트“ 1 1 1 3
Thames Valley 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Sussex, Surrey & Kent 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Midlands & East of England Β  Β  Β  Β  Β 
East Midlands 1 4 1 바카라 사이트“ 6
South Midlands & Hertfordshire 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Anglia & Essex 바카라 사이트“ 1 1 바카라 사이트“ 2
West Midlands 바카라 사이트“ 1 3 바카라 사이트“ 4
London Integrated Region Β  Β  Β  Β  Β 
London 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Public Health Wales Β  Β  Β  Β  Β 
Mid & West Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
North Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
South East Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Miscellaneous Β  Β  Β  Β  Β 
Other 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Not known 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 0
Total 2 9 23 1 35

This report was published in Health Protection Report volume 9 issue 23.