Research and analysis

Laboratory reports of respiratory infections made to CIDSC from PHE and NHS laboratories in England and Wales: weeks 2 to 5, 2015

Updated 12 January 2016

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Data are recorded by week of report, but include only specimens taken in the last 8 weeks (ie recent specimens).

Table 1. Reports of influenza infection made to CIDSC, by week of report

Week Week 2 Week 3 Week 4 Week 5 Total
Week ending 11/1/2015 18/1/2015 25/1/2015 1/2/2015 Β 
Influenza A 847 581 507 606 2541
Isolation 96 53 45 44 238
DIF * 1 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2
PCR 666 396 362 430 1854
Other 바카라 사이트  84 131 100 132 447
Influenza B 25 17 19 21 82
Isolation 2 1 2 바카라 사이트“ 5
DIF * 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
PCR 21 10 13 20 64
Other 바카라 사이트  2 6 4 1 13

* DIF = Direct Immunofluorescence.

바카라 사이트  Other = 바카라 사이트œAntibody detection - single high titre바카라 사이트 or 바카라 사이트œMethod not specified바카라 사이트.

Table 2. Respiratory viral detections by any method (culture, direct immunofluorescence, PCR, four-fold rise in paired sera, single high serology titre, genomic, electron microscopy, other method, other method unknown), by week of report

Week Week 2 Week 3 Week 4 Week 5 Total
Week ending 11/1/2015 18/1/2015 25/1/2015 1/2/2015 Β 
Adenovirus* 71 64 108 119 362
Coronavirus 42 23 45 96 206
Parainfluenza바카라 사이트  91 61 50 94 296
Rhinovirus 205 138 201 298 842
RSV 627 392 459 317 1795

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

Table 3. Respiratory viral detections by age group: weeks 2 to 5, 2015

Age group (years) <1 year 1-4 years 5-14 years 15-44 years 45-64 years β‰₯65 years Unknown Total
Adenovirus * 92 93 25 85 46 21 바카라 사이트“ 362
Coronavirus 64 39 10 28 23 41 1 206
Influenza A 142 134 122 611 578 1304 4 2895
Influenza B 3 1 8 21 27 29 바카라 사이트“ 89
Parainfluenza 바카라 사이트  63 57 14 20 48 92 2 296
Respiratory syncytial virus 1036 182 37 94 151 288 8 1796
Rhinovirus 308 136 50 103 103 141 1 842

* Respiratory samples only.

바카라 사이트  Includes parainfluenza types 1, 2, 3, 4 and untyped.

Table 4. Laboratory reports of infections associated with atypical pneumonia, by week of report

Week Week 2 Week 3 Week 4 Week 5 Total
Week ending 11/1/2015 18/1/2015 25/1/2015 1/2/2015 Β 
Coxiella burnettii 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Respiratory Chlamydia sp.* 1 2 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3
Mycoplasma pneumoniae 26 18 22 6 72
Legionella sp. 5 5 5 바카라 사이트“ 15

* Includes Chlamydia psittaci, Chlamydia pneumoniae, and Chlamydia sp detected from blood, serum, and respiratory specimens.

Table 5. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by week of report

Week Week 2 Week 3 Week 4 Week 5 Total
Week ending 11/1/2015 18/1/2015 25/1/2015 1/2/2015 Β 
Nosocomial 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Community 3 (1*) 4 (1*) 2 (2*) 바카라 사이트“ 9
Travel abroad 1 1 (1*) 2 (1*) 바카라 사이트“ 4
Travel UK 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 (1*) 바카라 사이트“ 1
Total 5 5 5 바카라 사이트“ 15
Male 4 4 3 바카라 사이트“ 11
Female 1 1 2 바카라 사이트“ 4

* Cases with onset of symptoms in 2015.

Fifteen cases were reported with pneumonia. Eleven males aged 43 to 91 years and four females aged 54 to 67 years. Nine cases had community-acquired infection and one case was reported to be associated with hospital infection. Three deaths were reported in a 63- year-old female and two males aged 72 and 76 years.

Five cases were reported with travel association: Canada (1), China (1), Thailand (1), Turkey (1) and United Kingdom (1).

Table 6. Laboratory reports of Legionnaires Disease cases in England and Wales, by PHE Centre: weeks 2 to 5, 2015

Region/Country Nosocomial Community Travel Abroad Travel UK Total
North of England Β  Β  Β  Β  Β 
North East 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Cheshire & Merseyside 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Greater Manchester 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 (1*) 바카라 사이트“ 1
Cumbria & Lancashire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Yorkshire & the Humber 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
South of England Β  Β  Β  Β  Β 
Devon, Cornwall & Somerset 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 1
Avon, Gloucestershire & Wiltshire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Wessex 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Thames Valley 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Sussex, Surrey & Kent 바카라 사이트“ 1 (1*) 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
Midlands & East of England Β  Β  Β  Β  Β 
East Midlands 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 (1*) 1
South Midlands & Hertfordshire 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Anglia & Essex 바카라 사이트“ 2 (2*) 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 2
West Midlands 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1 (1*) 바카라 사이트“ 1
London Integrated Region Β  Β  Β  Β  Β 
London 1 2 (1*) 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3
Public Health Wales Β  Β  Β  Β  Β 
Mid & West Wales 바카라 사이트“ 1 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 1
North Wales 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
South East Wales 바카라 사이트“ 3 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 3
Miscellaneous Β  Β  Β  Β  Β 
Other 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Not known 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“ 바카라 사이트“
Total 1 9 4 1 15

* Cases with onset of symptoms in 2015.

This report was published in Health Protection Report volume 9 issue 4.

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